La restauración ecológica en México es incipiente para uno de los países con mayor biodiversidad del mundo. Desafortunadamente, millones de pesos han sido gastados en programas de reforestación, con pocos o nulos conocimientos científicos, y sin datos oficiales de éxito. A pesar de que, a nivel mundial, la restauración ecológica ha adoptado un enfoque más científico y multidisciplinario, los aspectos fisiológicos y anatómicos de las plantas han recibido poca atención. En nuestro laboratorio evaluamos parámetros fisiológicos de plántulas y adultos de varias especies de manglar en laboratorio y campo con el objetivo de entender las respuestas ante los cambios en la salinidad, la inundación, y concentraciones de metales pesados. Los resultados muestran que, por ejemplo, Rhizophora mangle presentó una alta plasticidad fisiológica, pero, dependiendo de donde se desarrolle, pequeños cambios en la salinidad e inundación podrían afectar su crecimiento, desarrollo y supervivencia. La especie Laguncularia racemosa tuvo alta capacidad de almacenar plomo en raíces probablemente por su intrínseca alta capacidad antioxidante en las mismas. La especie Avicennia germinans, aparte de su alta tolerancia a la salinidad tuvo menor capacidad antioxidante, pero plántulas de esta especie tuvieron características que les permitieron tener un balance de energía adecuado a pesar de las altas radiaciones recibidas en sitios abiertos. Estas herramientas fisiológicas (y anatómicas y genéticas) pueden servir además para medir el éxito en la restauración de manera rápida y eficiente. Asimismo, proponemos que este enfoque de fisiología de la restauración puede adaptarse para evaluar la calidad del hábitat en bosques de manglar.