Se evaluó la diversidad de aves y mamíferos medianos y grandes y su relación con el Índice de Disturbio Antrópico (IDC) en la cuenca alta y baja de los ríos Bacanuchi y Sonora. Seleccionamos sitios con concentración natural de metales en el suelo (Tratamiento 1), sitios con concentración de metales por origen antrópico (Tratamiento 2) y sitios control (sin presencia de metales). En cada sitio se colocaron 10 cámaras trampa, activas durante 72 horas, en dos temporadas del año (secas y lluvias) en el 2018. Se realizó un análisis estadístico no paramétrico de Kruskal-Wallis y pruebas de t para determinar diferencias significativas en la riqueza, abundancia e índice de Shannon. Estas comparaciones se realizaron entre temporadas del año y entre condiciones por cuenca. Para obtener el IDC se siguió la metodología propuesta por Martorell y Peters (2005). Se realizaron correlaciones lineales, en las dos temporadas del año entre el IDC y los parámetros de diversidad. Obtuvimos  de 711 registros de capturas individuales, tanto de fauna silvestre como doméstica, que corresponde a dos grupos taxonómicos (mamíferos y aves), 31 familias, 43 géneros y 44 especies. Urocyon cinereoargenteus, Canis latrans, Lepus alleni y Odocoileus virginianus; fueron las especies más abundantes. En riqueza y abundancia se presentaron diferencias significativas entre temporadas, y fueron mayores en la temporada de secas. En temporada de secas se encontraron diferencias significativas donde la mayor riqueza y abundancia se registró en el tratamiento 1. En temporada de lluvias se presentaron diferencias entre los sitios en el tratamiento 2. Encontramos correlación entre el IDC y la abundancia y riqueza para la temporada de secas. Aunque el tiempo de muestreo es corto este estudio permite un inventario rápido sobre la riqueza y diversidad en ecosistemas riparios debido a que los estudios en este ecosistema son inexistentes.