Los cambios climático afectan a la agricultura y los medios de vida que sustentan. Para comprender la vulnerabilidad climática en los entornos agrícolas es necesario entender la forma como las personas perciben e interactúan con su entorno. Este estudio analiza las percepciones de los agricultores sobre un conjunto de indicadores de cambio climático y su influencia en las prácticas agrícolas en dos comunidades indígenas ubicadas en diferentes altitudes en la Sierra Negra de Puebla. Las observaciones de los agricultores se exploraron mediante entrevistas semiestructuradas y se contextualizaron dentro del registro climático instrumental local. La influencia de las percepciones de cambio climáticas de estos agricultores sobre sus prácticas agrícolas se analizó con mayor profundidad utilizando un modelo de regresión logística. Los cambios en la intensidad y estacionalidad de las lluvias, así como en la intensidad del viento, fueron los aspectos más mencionados. Las experiencias de los agricultores sugieren una reducción en la intensidad de la lluvia y el viento y temporadas de lluvias más cortas. Los recuerdos de años anómalos pasados ​​coinciden con las anomalías de precipitación encontradas en los registros instrumentales. Sin embargo, rara vez se percibieron cambios de temperatura e indicadores bióticos. Nuestros resultados muestran que la percepción de estos indicadores está mediada por las prácticas agrícolas, y encontramos evidencia que indica que estas percepciones durante la primera etapa del calendario estacional inducen reajustes en las fechas de siembra. Además, los agricultores recurren a la migración, la integración de cultivos comerciales y el uso de fertilizantes comerciales para hacer frente o reducir la pérdida de cultivos debido a los impactos climáticos.