El estudio de las comunidades faunísticas de los paisajes antrópicos y, específicamente, de los sitios en regeneración, merece especial atención por su influencia en el proceso sucesional que subyace a la regeneración de los ecosistemas, afectando el curso del proceso sucesional, la resiliencia de los ecosistemas y los servicios ecosistémicos. En el trópico, debe prestarse especial atención a las comunidades de murciélagos, ya que son claves para el funcionamiento de los ecosistemas, así como un modelo adecuado para abordar la respuesta de la fauna a la variación de los atributos del hábitat. En este estudio, evaluamos la respuesta de las comunidades de murciélagos, desde una perspectiva taxonómica y funcional, a la variación en los atributos de la vegetación y el paisaje producida por actividades antropogénicas en la región de Chamela-Cuixmala (Jalisco). Para ello, en 13 sitios de estudio (once representando estadios iniciales de la sucesión y dos representando estadios tardíos para referencia), caracterizamos: (1) la comunidad de murciélagos filostómidos y mormoópidos asociados con las etapas sucesional iniciales de un bosque tropical seco, (2) la respuesta de estas comunidades a la variación en los atributos de la vegetación y el paisaje, y (3) cómo la estancionalidad modula dicha respuesta. Esto nos permitió identificar los posibles mecanismos subyacentes a la respuesta de las comunidades de murciélagos a la perturbación humana. Nuestros resultados mostraron que las especies afectadas negativamente por la perturbación antropogénica son aquellas con mayor masa corporal, hojas nasales más grandes o una relación aspecto alar y una carga alar relativa más bajas, las cuales están adaptadas a forrajear en espacios reducidos dado su vuelo a baja velocidad, su alta capacidad de maniobrabilidad para evitar obstáculos y la alta direccionalidad en sus emisiones. También detectamos una mayor sensibilidad de los murciélagos a los cambios en los atributos del paisaje relativos al bosque ripario, en comparación con los del bosque seco, y que el efecto de la transformación antrópica en los murciélagos se intensificó durante la estación seca. Entonces, el efecto combinado de la transformación del hábitat y la estacionalidad puede provocar, en las primeras etapas de la sucesión, una reducciónn de la diversidad de murciélagos y un aumento de la dominancia de las pocas especies que pueden prosperar en estas condiciones. Asimismo, la pérdida continua de la vegetación original puede llevar a la pérdida de ciertos grupos de especies de murciélagos en paisajes neotropicales, reduciendo la resiliencia del sistema.