La valoración de la naturaleza física, química y biológica son el resultado de las evaluaciones e integridad de la calidad del agua, calidad ambiental y de macroinvertebrados acuáticos; cuya infromación de un grupo de sitios tiene como finalidad promover datos que puedan ser utilizados para definir condiciones actuales de los cauces. La subcuenca Río Copalita -RH21Ba, forma parte del complejo de la Cuenca de Río Copalita y otros, en la región de la Sierra Sur y Costa del estado de Oaxaca. Se establecieron estaciones de muestreo a lo largo de los caudales de los cauces principales que confroman a la subcuenca, en las temporadas climaticas de postlluvias y estiaje. Los resultados muestran diferencias enre los indicadores de los parametros fisicoquímicos, de la calidad ambiental visual y del índice de integridad biótica; sin embargo, los valores se encuentran dentro de los límites permisibles para los sitios. Como consecuencia e interpretación de los análisis que permiten realizar el biomonitoreo de las condiciones ambientales con relación al entorno natural, se reconocen que las variables fisicoquímicas más explicativas, de la calidad ambiental visual e índice de integridad biótica permiten conocer la Integridad Ecológica de los cauces en la subcuenca RH21Ba.