La Cuenca de México se localiza en la parte central del Eje Volcánico Transversal y sus sedimentos representan una valiosa fuente de información paleoambiental para la reconstrucción paleoclimática. En este trabajo presentamos los resultados de ostrácodos preservados en los sedimentos del Lago de Chalco y de Texcoco que representan los últimos 145,000 y 34,000 años, respectivamente. Los ostrácodos son crustáceos bivalvos que responden relativamente rápido a cambios ambientales y climáticos. Sus cambios en cuanto a diversidad y abundancia en sedimentos lacustres representan una poderosa herramienta para reconstruir las condiciones ecológicas y fisicoquímicas de un lago. El perfil sedimentario del Lago de Chalco presenta una longitud de 122 m y su modelo de edad es calculado con base en 14 edades de radiocarbono, dos depósitos de tefra y una edad 230Th/U procedente de zircón extraído. Por otra parte, el perfil sedimentario del Lago de Texcoco presenta una longitud de 10.8 m y su modelo de edad está calculado con base en 5 edades de radiocarbono y 2 depósitos volcánicos. Para este trabajo se analizaron 116 muestras sedimentarias procedentes del Lago de Chalco y 32 muestras sedimentarias procedentes del Lago de Texcoco. Aproximadamente 3 g de sedimento seco por muestra fue sumergido en agua por dos días. Posteriormente el sedimento fue lavado y tamizado por mallas de 53 μm y 240 μm. Los residuos fueron secados en horno convencional y analizados por medio de un microscopio estereoscópico Zeiss (Stemi 508). Los resultados se presentan como la abundancia total de ostrácodos cuantificados (adultos y juveniles) en 1 g de sedimento (valvas/g). Las valvas adultas (machos y hembras) de cada especie se presentan en abundancias relativas (%) y las inferencias paleoecológicas se desarrollan con base en los resultados de los ostrácodos adultos ya que los estadíos finales se presentan bajo las condiciones ambientales óptimas para cada especie. 4 especies de ostrácodos (Limnocytherina axalapasco, Candona alchichica, Candona patzcuaro, y Cypridopsis vidua) fueron encontradas en los sedimentos de la Cuenca de México. L. axalapasco y C. alchichica representan dos especies endémicas del centro de México y por lo tanto se conoce muy poco con respecto a sus preferencias ecológicas. En este trabajo sugerimos el posible origen y transición de adaptación de dichas especies a las condiciones ecológicas actuales. L. axalapasco, una especie de condiciones someras y adaptándose a condiciones de lago profundo, mientras que C. alchichica se adaptó de condiciones de lago diluidas a concentradas.